嘉兴科技城不仅拉开了浙江省兴建科技城的序幕，更是得到国家领导人的关注。习近平总书记也在2014年作出重要批示，对嘉兴科技城领先全国的校（院）地合作模式给予充分肯定。
浙江清华长三角研究院生态环境研究所的技术，应用于南湖区农村治水实践，经过处理的生活污水可以像自来水一样排入河道。这个工程还被国家环保部列为“农村分散型水污染物减排试点项目”示范工程。2003年底，浙江省政府与清华大学在南湖合作共建了浙江清华长三角研究院。以此为契机，嘉兴科技城诞生。可以说，从成立之初，嘉兴科技城就拥有浙江清华长三角研究院这一大院名校资源优势。
随后，嘉兴科技城又引进了浙江中科院应用技术研究院、俄罗斯科学院等十余家国内外知名科研院校，在全国率先开创的省校（院地）合作模式先发优势明显。浙江清华长三角研究院在国内首次提出“政产学研金介用”一体化“北斗七星”创新体系并带头实践。浙江中科院应用技术研究院开创了中科院院地合作规模与层次的先例。
今年，嘉兴科技城又与清华大学软件学院、中科院地球与地质物理所、上海大学等大院名校合作共建了浙江未来技术研究院（嘉兴）、中科院地球与地质物理所嘉兴工程中心、上海大学（浙江）新兴产业研究院等创新载体，启迪之星、ANT国际联合办公等众创空间建设，积极开创一条以搭建创新平台和助推科创孵化为特色的发展道路。
在全国双创示范基地审核中，不仅要看申报对象的科研创新实力，还要看其创业氛围和成果情况，以及平台的打造和政策配套是否完善等。嘉兴科技城在人才培育引进、科技金融、科技体制等方面的创新性探索实践，开辟出一条创业“快车道”，极大地推动了嘉兴科技城这个长三角创业创新平台的快速发展。
嘉兴科技城在全国率先成立了人才局，今年又在全市率先出台了人才政策双十条，在创新创业扶持、创投基金引导、引才育才奖励等十个方面加大扶持力度，并设立一个人才服务热线，开通一条人才就医绿色通道，制定一本人才服务绿卡等，提升人才服务水准，赢得了高精尖人才的高度集聚。
对于创新创业中常见的资金问题，嘉兴科技城积极对接省级特色小镇南湖基金小镇“投融圈”，建立创业引导资金激励机制，探索引入社会资本共建产业基金，并计划在全国率先建立了科技保险机制，从而初步形成“政府引导-基金合作-科技担保”同步发展的立体化科技金融新机制。像科技城与容亿投资基金合作设立了容江基金，一年内就培育了20多家优质创新企业。引进的各类银行、中小企业担保公司截至2016年底，已累计为25家领军人才企业提供担保。最近，嘉兴科技城还将创新性设立人才创业引导基金、探索性地成立人才银行，为人才创业注入新活力。